在生命科學(xué)研究中，細(xì)胞的空間位置信息是理解組織功能、疾病機(jī)制和發(fā)育過程的關(guān)鍵。锘海生命科學(xué)憑借組織透明化3D成像技術(shù)，為科研工作者提供從樣本處理、高分辨率成像到數(shù)據(jù)分析的一站式解決方案，助力探索生命科學(xué)的微觀宇宙！锘海生命科學(xué)最新推出單細(xì)胞空間多組學(xué)與高通量蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)服務(wù)，依托空間組學(xué)、單細(xì)胞多組學(xué)及高通量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)平臺(tái)，結(jié)合組織透明化3D熒光成像技術(shù)，為腫瘤、免疫、神經(jīng)、發(fā)育、慢性疾病及大隊(duì)列研究提供從樣本制備、多維解析到深度數(shù)據(jù)挖掘的全鏈條解決方案。

為什么選擇空間組學(xué)？

生命體的復(fù)雜性源于細(xì)胞在組織中的空間異質(zhì)性。傳統(tǒng)技術(shù)雖能解析基因或蛋白表達(dá)，卻無法保留空間位置信息?？臻g組學(xué)通過原位檢測(cè)單細(xì)胞/多細(xì)胞的基因、蛋白表達(dá)譜，結(jié)合空間坐標(biāo)，揭示細(xì)胞間相互作用、微環(huán)境特征及疾病機(jī)制。這一技術(shù)被《Nature》《Science》等頂級(jí)期刊評(píng)為“年度技術(shù)”，并成為臨床病理、腫瘤免疫、神經(jīng)科學(xué)等領(lǐng)域的核心工具。

01創(chuàng)新空間多組學(xué)技術(shù)平臺(tái)

打造創(chuàng)新空間多組學(xué)技術(shù)平臺(tái)，覆蓋RNA、蛋白、代謝等多維度分析，兼容FFPE、冷凍樣本等多種類型，為科研提供精準(zhǔn)、高效的支持。

研究設(shè)計(jì)

在組織空間維度全面揭示了巨噬細(xì)胞的多樣性和可塑性，結(jié)果發(fā)現(xiàn)巨噬細(xì)胞和炎性成纖維細(xì)胞參與構(gòu)建了強(qiáng)大的通訊網(wǎng)絡(luò)，闡釋了人類炎性腸病的細(xì)胞復(fù)雜性和導(dǎo)致IBD異質(zhì)性的潛在機(jī)制。

案例分析-DSP

DSP（1個(gè)SLS+1個(gè)IS）：探究腫瘤空間微環(huán)境

本研究提示mTORC1高活性的干細(xì)胞樣狀態(tài)腫瘤細(xì)胞通過免疫抑制，存在一種自分泌雷帕霉素耐藥機(jī)制和旁分泌腫瘤生存機(jī)制。

03空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析展示-基礎(chǔ)分析

聚類分群在 H&E 染色圖上的分布

分群可視化圖（TSNE/UMAP）

特定marker的空間分布組織圖

組織掃描熒光圖

細(xì)胞類型統(tǒng)計(jì)圖

04空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析展示-高級(jí)分析

1、Spatial PCA：增加空間聚類準(zhǔn)確性

Spatial PCA是一種空間的降維方法，建立在PCA的基礎(chǔ)上，將定位信息作為額外的輸入，并使用核矩陣來明確地模擬不同組織位置的空間相關(guān)結(jié)構(gòu)。

2、BayesSpace：增加空間分辨率

BayesSpace，一種完全貝葉斯統(tǒng)計(jì)方法，通過使用來自空間鄰域的信息來增強(qiáng)空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分辨率并進(jìn)行聚類分析，能夠有效識(shí)別具有相似表達(dá)譜的空間簇以及提高空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)分辨率。

3、CellTrek：根據(jù)scRNA-seq和ST數(shù)據(jù)直接將單個(gè)細(xì)胞映射到組織切片的空間坐標(biāo)

4、Cell2location：將單個(gè)細(xì)胞參考細(xì)胞類型映射到空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集

5、SPOTlight：識(shí)別每個(gè)spot中的細(xì)胞類型和比例

6、SMI數(shù)據(jù)基因共表達(dá)分析

7、SMI數(shù)據(jù)基因共表達(dá)分析

05SBC ToolBox 生信分析云平臺(tái)

生信云平臺(tái)一共有12大板塊，110個(gè)生信數(shù)據(jù)分析模塊，主要包括數(shù)據(jù)線上渲染、線上圖形化及云端在線數(shù)據(jù)分析等功能，不管是基礎(chǔ)的差異分析，差異基因展示還，還是趨勢(shì)分析、功能富集，醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)分析，抑或是當(dāng)下火熱的單細(xì)胞、空間轉(zhuǎn)錄組大數(shù)據(jù)，登錄云平臺(tái)在線數(shù)據(jù)交互，提交分析，結(jié)果立等可取，省時(shí)、省心、省力，生物信息云平臺(tái)讓您的數(shù)據(jù)分析變的更簡(jiǎn)單、更可靠。